Thuốc nhuộm Feulgen và kỹ thuật xử lý trong phương pháp nhuộm Feulgen chủ yếu dựa vào khả năng hấp thu các hoá chất kiềm tính của ADN, bởi vì ADN là chất có tính axit cao do cấu tạo phân tử có hàm lượng -HPO4 nhiều.
Trong mô, cấu trúc nào có lượng ADN càng đậm đặc, thì tính axit càng cao, nên bắt màu càng nhiều, hiện ra càng rõ giúp dễ dàng quan sát trên kính hiển vi quang học thông thường.
